Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ssrp1Q08943 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms