Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms