Protein–RNA interactions for Protein: Q05CL8

Larp7, La-related protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp7Q05CL8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Larp7Q05CL8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Larp7Q05CL8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Larp7Q05CL8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Larp7Q05CL8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Larp7Q05CL8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Larp7Q05CL8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Larp7Q05CL8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Larp7Q05CL8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Larp7Q05CL8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Larp7Q05CL8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Larp7Q05CL8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Larp7Q05CL8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Larp7Q05CL8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Larp7Q05CL8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Larp7Q05CL8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Larp7Q05CL8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms