Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdk16Q04735 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms