Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcad1Q04692 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms