Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms