Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cxcr5Q04683 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms