Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk7Q03147 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms