Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp11Q02853 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms