Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col6a2Q02788 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms