Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RykQ01887 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RykQ01887 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RykQ01887 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RykQ01887 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RykQ01887 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RykQ01887 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RykQ01887 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RykQ01887 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RykQ01887 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RykQ01887 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RykQ01887 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RykQ01887 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RykQ01887 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RykQ01887 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RykQ01887 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RykQ01887 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RykQ01887 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RykQ01887 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RykQ01887 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RykQ01887 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RykQ01887 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RykQ01887 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RykQ01887 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RykQ01887 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RykQ01887 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RykQ01887 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RykQ01887 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RykQ01887 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RykQ01887 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RykQ01887 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RykQ01887 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RykQ01887 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RykQ01887 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RykQ01887 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RykQ01887 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RykQ01887 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RykQ01887 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RykQ01887 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RykQ01887 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RykQ01887 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RykQ01887 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RykQ01887 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RykQ01887 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RykQ01887 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RykQ01887 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RykQ01887 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RykQ01887 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RykQ01887 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RykQ01887 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RykQ01887 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RykQ01887 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RykQ01887 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RykQ01887 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RykQ01887 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RykQ01887 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RykQ01887 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RykQ01887 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RykQ01887 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RykQ01887 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RykQ01887 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RykQ01887 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RykQ01887 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RykQ01887 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RykQ01887 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RykQ01887 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RykQ01887 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RykQ01887 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RykQ01887 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RykQ01887 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RykQ01887 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RykQ01887 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RykQ01887 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RykQ01887 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RykQ01887 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RykQ01887 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RykQ01887 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RykQ01887 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RykQ01887 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RykQ01887 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RykQ01887 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RykQ01887 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RykQ01887 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RykQ01887 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RykQ01887 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RykQ01887 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RykQ01887 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RykQ01887 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RykQ01887 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RykQ01887 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RykQ01887 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RykQ01887 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RykQ01887 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RykQ01887 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RykQ01887 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RykQ01887 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RykQ01887 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RykQ01887 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RykQ01887 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RykQ01887 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms