Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms