Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp1Q01514 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms