Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EgfrQ01279 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EgfrQ01279 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms