Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde1bQ01065 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde1bQ01065 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms