Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

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Length 53 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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