Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms