Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
F8a1Q00558 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms