Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gbp10Q000W5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gbp10Q000W5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbp10Q000W5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbp10Q000W5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbp10Q000W5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbp10Q000W5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbp10Q000W5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbp10Q000W5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp10Q000W5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp10Q000W5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms