Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lama4P97927 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lama4P97927 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lama4P97927 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lama4P97927 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lama4P97927 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lama4P97927 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lama4P97927 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lama4P97927 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lama4P97927 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lama4P97927 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms