Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig3P97386 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig3P97386 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig3P97386 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig3P97386 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig3P97386 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig3P97386 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig3P97386 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig3P97386 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig3P97386 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig3P97386 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig3P97386 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig3P97386 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig3P97386 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms