Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis3P97368 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis3P97368 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Meis3P97368 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Meis3P97368 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Meis3P97368 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Meis3P97368 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Meis3P97368 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meis3P97368 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meis3P97368 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis3P97368 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Meis3P97368 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis3P97368 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis3P97368 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms