Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

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Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkdcP97313 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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