Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx1P81068 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx1P81068 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx1P81068 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx1P81068 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx1P81068 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irx1P81068 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx1P81068 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx1P81068 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms