Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptprn2P80560 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptprn2P80560 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms