Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msx3P70354 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msx3P70354 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msx3P70354 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msx3P70354 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msx3P70354 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msx3P70354 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msx3P70354 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msx3P70354 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msx3P70354 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msx3P70354 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msx3P70354 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Msx3P70354 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msx3P70354 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msx3P70354 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msx3P70354 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Msx3P70354 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msx3P70354 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Msx3P70354 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msx3P70354 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Msx3P70354 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Msx3P70354 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msx3P70354 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msx3P70354 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msx3P70354 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msx3P70354 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msx3P70354 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msx3P70354 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msx3P70354 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msx3P70354 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msx3P70354 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msx3P70354 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms