Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprvP70289 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprvP70289 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprvP70289 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprvP70289 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprvP70289 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprvP70289 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprvP70289 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PtprvP70289 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprvP70289 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PtprvP70289 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprvP70289 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprvP70289 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprvP70289 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprvP70289 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprvP70289 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtprvP70289 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms