Protein–RNA interactions for Protein: P70263

Ptgdr, Prostaglandin D2 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgdrP70263 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtgdrP70263 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtgdrP70263 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtgdrP70263 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtgdrP70263 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtgdrP70263 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtgdrP70263 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtgdrP70263 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtgdrP70263 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtgdrP70263 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtgdrP70263 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtgdrP70263 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtgdrP70263 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtgdrP70263 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms