Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubb4bP68372 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms