Protein–RNA interactions for Protein: P63328

Ppp3ca, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp3caP63328 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Ppp3caP63328 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp3caP63328 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms