Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmgb1P63158 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgb1P63158 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms