Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps3P62908 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rps3P62908 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rps3P62908 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps3P62908 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps3P62908 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps3P62908 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps3P62908 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps3P62908 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps3P62908 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms