Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpd3P62320 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 350 ms