Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp46P62069 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp46P62069 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp46P62069 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp46P62069 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp46P62069 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp46P62069 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp46P62069 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp46P62069 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp46P62069 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp46P62069 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp46P62069 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp46P62069 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp46P62069 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp46P62069 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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