Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SnnP61807 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnnP61807 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnnP61807 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnnP61807 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnnP61807 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnnP61807 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnnP61807 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnnP61807 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnnP61807 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnnP61807 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnnP61807 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SnnP61807 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnnP61807 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SnnP61807 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SnnP61807 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SnnP61807 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnnP61807 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnnP61807 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnnP61807 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnnP61807 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnnP61807 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnnP61807 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnnP61807 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnnP61807 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnnP61807 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnnP61807 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnnP61807 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnnP61807 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnnP61807 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnnP61807 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnnP61807 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnnP61807 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnnP61807 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnnP61807 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnnP61807 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnnP61807 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnnP61807 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnnP61807 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnnP61807 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnnP61807 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnnP61807 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnnP61807 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnnP61807 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnnP61807 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnnP61807 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnnP61807 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnnP61807 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnnP61807 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnnP61807 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnnP61807 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnnP61807 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnnP61807 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnnP61807 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnnP61807 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnnP61807 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnnP61807 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnnP61807 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnnP61807 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnnP61807 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnnP61807 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnnP61807 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnnP61807 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnnP61807 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnnP61807 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnnP61807 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnnP61807 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnnP61807 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnnP61807 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnnP61807 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnnP61807 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnnP61807 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnnP61807 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnnP61807 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnnP61807 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnnP61807 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnnP61807 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnnP61807 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnnP61807 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnnP61807 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnnP61807 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnnP61807 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnnP61807 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnnP61807 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnnP61807 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnnP61807 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnnP61807 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnnP61807 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnnP61807 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnnP61807 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnnP61807 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnnP61807 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnnP61807 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnnP61807 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SnnP61807 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnnP61807 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnnP61807 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnnP61807 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnnP61807 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnnP61807 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms