Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms