Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chp1P61022 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chp1P61022 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chp1P61022 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chp1P61022 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chp1P61022 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chp1P61022 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chp1P61022 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chp1P61022 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chp1P61022 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chp1P61022 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chp1P61022 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chp1P61022 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chp1P61022 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chp1P61022 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chp1P61022 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chp1P61022 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chp1P61022 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chp1P61022 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chp1P61022 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chp1P61022 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chp1P61022 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chp1P61022 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chp1P61022 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chp1P61022 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chp1P61022 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chp1P61022 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chp1P61022 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chp1P61022 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chp1P61022 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chp1P61022 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chp1P61022 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chp1P61022 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chp1P61022 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chp1P61022 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chp1P61022 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chp1P61022 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chp1P61022 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chp1P61022 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chp1P61022 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chp1P61022 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chp1P61022 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chp1P61022 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chp1P61022 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chp1P61022 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chp1P61022 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Chp1P61022 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chp1P61022 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chp1P61022 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chp1P61022 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chp1P61022 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chp1P61022 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms