Protein–RNA interactions for Protein: P59672

Anks1a, Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Anks1aP59672 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Anks1aP59672 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Anks1aP59672 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms