Protein–RNA interactions for Protein: P59481

Lman2l, VIP36-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lman2lP59481 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lman2lP59481 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lman2lP59481 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2lP59481 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms