Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdrg1P59048 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms