Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Vps33bP59016 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vps33bP59016 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms