Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms