Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GferP56213 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GferP56213 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GferP56213 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GferP56213 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GferP56213 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GferP56213 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GferP56213 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GferP56213 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GferP56213 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GferP56213 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GferP56213 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GferP56213 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GferP56213 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GferP56213 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GferP56213 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GferP56213 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GferP56213 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GferP56213 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GferP56213 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GferP56213 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GferP56213 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GferP56213 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GferP56213 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GferP56213 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GferP56213 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GferP56213 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GferP56213 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GferP56213 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GferP56213 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GferP56213 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GferP56213 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GferP56213 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GferP56213 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GferP56213 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GferP56213 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GferP56213 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GferP56213 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GferP56213 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GferP56213 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GferP56213 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GferP56213 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GferP56213 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GferP56213 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GferP56213 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GferP56213 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GferP56213 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GferP56213 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GferP56213 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GferP56213 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GferP56213 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GferP56213 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GferP56213 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GferP56213 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GferP56213 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GferP56213 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GferP56213 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GferP56213 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GferP56213 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GferP56213 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GferP56213 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GferP56213 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GferP56213 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GferP56213 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GferP56213 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GferP56213 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GferP56213 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GferP56213 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GferP56213 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GferP56213 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GferP56213 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GferP56213 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GferP56213 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GferP56213 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GferP56213 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GferP56213 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GferP56213 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GferP56213 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GferP56213 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GferP56213 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GferP56213 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GferP56213 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GferP56213 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GferP56213 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GferP56213 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GferP56213 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GferP56213 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GferP56213 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GferP56213 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GferP56213 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GferP56213 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GferP56213 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GferP56213 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GferP56213 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GferP56213 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GferP56213 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GferP56213 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GferP56213 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GferP56213 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GferP56213 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms