Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ephb3P54754 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms