Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacnb3P54285 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cacnb3P54285 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms