Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms