Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CebpaP53566 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CebpaP53566 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CebpaP53566 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CebpaP53566 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CebpaP53566 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CebpaP53566 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CebpaP53566 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CebpaP53566 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CebpaP53566 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CebpaP53566 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms