Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ClgnP52194 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ClgnP52194 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ClgnP52194 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ClgnP52194 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ClgnP52194 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ClgnP52194 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ClgnP52194 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ClgnP52194 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ClgnP52194 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ClgnP52194 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ClgnP52194 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ClgnP52194 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms