Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms