Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atoh1P48985 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atoh1P48985 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms