Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptx3P48759 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms